荧光定量PCR是指在PCR反应体系中加入荧光基团，利用荧光信号累积实时监测整个PCR进程，zui后通过标准曲线对初始模板进行定量分析的方法。它的出现解决了传统PCR不能对初始模板定量分析的问题。具有准确性高、灵敏度高、特异性强等优点，目前已广泛应用于分子生物学研究和医学研究等领域。
荧光定量PCR结果分析：
一般而言，荧光扩增曲线可以分成三个阶段：荧光背景信号阶段、荧光信号指数扩增阶段和平台期。在荧光背景信号阶段，扩增的荧光信号被荧光背景信号所掩盖，无法判断产物量的变化；在平台期，扩增产物已不再呈指数级增加，PCR终产物量与起始模板量之间没有线性关系，无法计算起始模板拷贝数。因此只有在荧光信号指数扩增阶段，PCR产物量的对数值与起始模板量之间存在线性关系，故选择在这个阶段进行定量分析。为了定量方便，在荧光定量PCR技术中引入了几个重要的概念：扩增曲线、荧光阈值、CT值。
注：
横坐标：代表扩增循环数;
纵坐标：代表荧光强度，每个循环进行一次荧光信号收集。
(2)荧光阈值(Threshold)
在荧光扩增曲线上人为设定的一个值，它可以设定在荧光信号指数扩增阶段任意位置上，但一般荧光阈值的设置是PCR反应前3-15个循环荧光信号标准偏差的10倍。
(3)CT值
每个反应管内的荧光信号到达设定阈值时所经历的循环数。每个模板的Ct值与该模板的起始拷贝数的对数存在线性关系，起始拷贝数越多，Ct值越小。利用已知起始拷贝数的标准品可作出标准曲线，其中横坐标代表起始拷贝数的对数，纵坐标代表Ct值。因此，只要获得未知样品的Ct值，即可从标准曲线上计算出该样品的起始拷贝数。同时，对于荧光PCR实验来说，CT值也是判读样品阴阳性的重要指标。
