Hoechst是一类DNA染料，与DNA双链中的小沟（minor groove）结合，可穿过细胞膜，可结合于活细胞或固定过的细胞，因此可用于活细胞标记，可用荧光显微镜检测形态学的细胞凋亡情况。

碱性磷酸酶染色 测定中性粒细胞内碱性磷酸酶活性。当粒细胞内有碱性磷酸酶存在时，在缓冲液（pH9.0－9.8）中，可将温育液中的底物（β甘油磷酸酶）水解为磷酸根和甘油，磷酸根再与硝酸钙中的Ca2＋结合为磷酸钙沉淀，此沉淀物再与硝酸钴、硫酸铵等起一系列化学反应，Z后生成不溶性的黑色硫化钴（CoS），定位于酶活性所在部位。

刚果红染色法 刚果红能与培养基中的纤维素形成红色复合物。当纤维素被纤维素酶分解后，刚果红——纤维素的复合物便没法形成，培养基中会出现以纤维素分解菌为中心的透明圈，通过是否产生透明圈来筛选纤维素分解菌

Von Kossa染色 Von Kossa’s矿化结节染色法 原理是将矿化基质中的磷酸盐（钙）、碳酸盐（钙）转变为磷酸银、碳酸银，然后用日光、紫外线或强还原剂使其还原为黑色的金属银。本试验染色过程中未作细胞衬染。

EVG染色全称VERHOEFF’S VAN GIESON染色，能显示黑色弹性纤维与红色胶原纤维,一些弹性组织萎缩的肺气肿病例,动脉粥样硬化的弹性纤维变薄和缺失,及其他血管疾病,或者是随着年龄的增加皮肤的弹性纤维发生裂隙或破碎等改变,并使皮肤松弛和形成皱纹等等均可使用此方法进行鉴别。

Van Gieson（VG）染色 胶原纤维在HE染色法被染成粉红色，除此之外，它还可以用一些阴离子的染料来进行染色，如用淡绿可把它们染为绿色，用甲苯胺蓝可将其染为蓝色，在网状纤维染色中，如不加以处理，它又可被染为棕黄色。常用的特殊染色法有Van Gieson.Masson和Mallary等方法。在免疫细胞化学染色中，胶原纤维由于含的负电荷过多，常导致某些非特异性的染色，应特别注意。